超高壓色譜柱在高效液相色譜分析系統中，對色譜柱溫度控制的要求越來越高，藥典及諸多新的分析方法，也對柱溫給出條件，由于色譜柱恒溫箱可以、穩定的控制色譜柱的使用溫度，對于提高色譜柱的柱效，改善色譜峰的分離度，縮短保留時間，降低反壓，保證分析樣品結果的重復性，具有不可忽視的作用。使其成為高效液相色譜儀的重要配套裝置。
超高壓色譜柱的使用注意溫度和酸堿度：
一般以硅膠為基質的色譜柱較高使用溫度不超過60℃，以低于40℃為宜，特別是在流動相pH接近使用限度時，更應降低使用溫度。溫度過高會加快鍵合相的水解和硅膠的溶解，從而，使填料性質改變，柱床塌陷，降低柱效，改變峰形。目前的鍵合硅膠色譜柱標示的pH適用范圍可達2～10，但在實際使用時應避免pH條件，特別是在偏堿性的條件（pH≥8）下使用，如必須要在pH條件下使用時，可通過以下方法避免柱損害：
（1）在泵和進樣閥之間加裝預柱（飽和柱）來飽和流動相；
（2）降低使用溫度；
（3）檢驗完畢后立即用與所使用的流動相互相混溶的“溫和溶劑”*清洗。
超高壓色譜柱的注意事項：
1、保持室內整潔、干凈、無塵，溫度控制一般在20-25℃之間，相對濕度50-70%。
2、電源要求相對穩定，電壓變化要小，配有不間斷穩壓電源。
3、溶劑和流動相要求使用0。22μm的濾膜過濾，水相和溶劑相的使用不得超過2天。
4、開高壓前一定要先開氮氣，關氮氣前一定要先關高壓。
5、要避免使用非揮發性的鹽、表面活性劑、清潔劑和無機酸等。
6、實驗完畢后要清洗進樣針、進樣閥等，用過含酸的流動相后，色譜柱、離子源都要用甲醇/水沖洗。
7、按照要求定期清洗一級錐孔，一般一個月清洗一次。
8、定期檢查機械泵的油的狀態，如果發現渾濁、缺油等狀況或者累計運行超過3000小時，要即使更換機械泵油。
