柱溫波動：控制好柱子和流動相的溫度，檢查是否有打開的窗戶或空調對著柱溫箱。

流通池被污染或有氣體：用甲醇或其他強極性溶劑沖洗流通池（最好斷開柱子）。如有需要，可以用1N的硝酸（不要用鹽酸）。

紫外燈能量不足：更換新的紫外燈。

流動相污染、變質或由低品質溶劑配成：檢查流動相的組成，使用高品質的化學試劑及HPLC級的溶劑。

流動相的pH值沒有調節好：加適量的酸或堿調至最佳pH值。

柱溫變化：在每一次運行之前給予足夠的時間平衡色譜柱。

色譜柱沒有平衡好：在每一次運行之前給予足夠的時間平衡色譜柱。

柱污染：每天沖洗柱。

柱內條件變化：穩定進樣條件，調節流動相。

柱壽命到：更換色譜柱。

柱超載：降低樣品量，增加柱直徑采用較高容量的固定相。

柱干擾：清潔樣品，調整流動相。

柱效下降：采用較低腐蝕條件，更換柱，采用保護柱。

柱內燒結不銹鋼失效：更換燒結不銹鋼，增加在線過濾器，過濾樣品。

柱塌陷或形成短通道：更換色譜柱，采用弱腐蝕條件。

死體積或柱外體積過大：連接點降至zui低，對所有連接點做合適調整，盡可能采用細內徑連接管。